- 穿孔亜目 Terebrantia
- メロアザミウマ科 Merothripidae
- Merothripssp.（未同定）白谷林道；リター
- アザミウマ科 Thripidae
- アミメアザミウマ亜科 Pnachaetothripinae
- Anisopilothrips venustulus(Priesner)猿川；ススキ
- Helionothrips cephalicusHood尾之間，春牧；ススキ
- Heliothrips haemorrhoidalis(Bouche) クロトンアザミウマ大川林道；樹種未同定，猿川，千尋滝付近；ススキ，麦生；モクタチバナ
- アザミウマ亜科 Thripinae
- Anaphothrips sudanensisTrybom アワキオビアザミウマ永田；イネ科草本類，椨川；ササ類
- *Bolacothrips evittatus(Sakimura)春牧；ススキ
- Chaetanaphothripssp.（未同定）麦生；ササ類
- Megalurothrips distalis(Karny) マメハナアザミウマ尾之間；アオモジ
- Microsephalothrips abdominalis(Crawford) コスモスアザミウマ麦生；ササ類
- Scirtothrips dorsalisHood チャノキイロアザミウマ麦生；タブ新芽，永田；イネ科草本類，麦生；ササ類，大川；モクタチバナ，春牧；ヨモギ，大川；樹種未同定，春牧；ススキ，猿川；ガジュマル林リター
- Scirtothrips machiliMasumoto et Okajima麦生；タブ新芽，尾之間；タブ，大川；モクタチバナ，大川；樹種未同定
- Stenchaetothrips indicus(Ramakrishna & Margabandhu)千尋滝付近；ササ類
- Stenchaetothripssp.（未同定）尾之間，千尋滝付近；ススキ，尾之間；ササ類
- Thrips flavusSchrank キイロハナアザミウマ尾之間；タブ，春牧；ヨモギ，大川；モクタチバナ，麦生；ササ類
- Thrips hawaiienesis(Morgan) ハナアザミウマ麦生，尾之間；タブ，尾之間，猿川；ススキ，原，千尋滝付近，尾之間；ササ類，大川；モクタチバナ，春牧；ヨモギ類，尾之間；アオモジ
- Thrips nigropilosusUzel クロゲハナアザミウマ春牧；ヨモギ
- Thrips palmiKarny ミナミキイロアザミウマ春牧；ヨモギ
- Thrips sukkiBhatti et Lee椨川；ヨモギ
- *Tsutsumiothrips ryukyuensisMasumoto麦生，湯泊，椨川；ササ類
- 有管亜目 Tubulifera
- クダアザミウマ科 Phlaeothripidae
- オオアザミウマ亜科 Idolothripinae
- *Acallurothrips nonakaiOkajima高平；枯木
- Bactrothrips brevitubusTakahashi大川；タブ枯葉
- Dichaetothrips sectorMound et Palmer国割岳西：枯木
- Ethirothrips virgulae(Chen)尾之間，永田，仲間川林道，国割岳西；枯木
- Gastrothrips acutulusOkajima国割岳西；枯木
- Holurothrips morikawaiKurosawa千尋滝付近；広葉樹林リター
- Megalothrips curvidensOkajima尾之間；枯葉
- *Mecynothrips pugilator(Karny)＊＊；枯葉
- Nesothrips brevicollis(Bagnall)安房，永田，千尋滝付近，尾之間，猿川；ススキ，尾之間，高平；枯木，千尋滝付近，大川；ササ類，永田；イネ科草本類
- クダアザミウマ亜科 Phlaeothripinae
- Azaleothrips moundiOkajima麦生，高平；枯木
- Ecacanthothrips inarmatusKurosawa トゲナシクダアザミウマ永田，尾之間，大川林道，仲間川林道；枯木・枯葉
- *Ecacanthothrips tibialis(Ashmead)大川林道；枯木・枯葉Haplothrips aculeatus (Fabricius) イネクダアザミウマ尾之間；ササ類，尾之間；タブ
- ?Haplothrips chinensisPriesner シナクダアザミウマ尾之間；アオモジ，湯泊；ユズリハ，尾之間；ススキ，尾之間；ササ類，春牧；ヨモギ
- Haplothrips kurdjumoviKarny ハナクダアザミウマ春牧；ヨモギ
- Haplothrips ganglbaueriSchmutz椨川，湯泊；ササ類
- ?Haplothrips gowdeyi(Franklin) アカオビハナクダアザミウマ尾之間；タブ，尾之間；ススキ，大川；モクタチバナ，高平；枯木？
- Holothrips hagaiOkajima大川林道，平野，国割岳西，白谷林道；枯木・枯葉
- Holothrips latidentisOkajima大川林道；枯葉
- Holothrips yuasai(Kurosawa)白谷林道，尾之間；枯木・枯葉
- *Hoplandrothrips ryukyuensis(Okajima)高平，大川林道；枯木・枯葉
- Hoplandrothripssp.（未同定）尾之間，永田，白谷林道；枯葉
- Hoplothripssp.（未同定）永田，平野；枯木
- Karnyothrips melaleucus(Bagnall)尾之間；ササ類，千尋滝付近，尾之間；ススキ，椨川；タケ類，大川；モクタチバナ？
- Karnyothripssp.（未同定）永田；樹種未同定，湯泊；ササ類
- Liothrips kuwanai(Moulton) フウトウカズラクダアザミウマ麦生；ササ類，長久保，志戸子；フウトウカズラ
- Liothrips piperinusPriesner フウトウカズラヤドリクダアザミウマ長久保，志戸子；フウトウカズラクダアザミウマgall内
- *Mesothrips claripennisMoulton モクタチバナクダアザミウマ尾之間，麦生，猿川，長久保；モクタチバナ，大川；樹種未同定
- Plectrothrips bicolorOkajima志戸子；ガジュマル
- Podothrips sasacolaKurosawa ササクダアザミウマ麦生，尾之間；ササ類
- Psalidothrips lewisi(Bagnall)大川，千尋滝付近；広葉樹林リター，猿川；ガジュマル林リター
- Stephanothrips japonicusSaikawa大川，千尋滝付近；広葉樹林リター
- *Stephanothrips occidentalisHood et Williams猿川；未同定，猿川；ガジュマル林リター
- *Stigmothrips infirmusAnanthakrishnan永田岬；タケ類
- Xylaplothripssp.（未同定）高平；枯木
*印を付した種類はこれまでに琉球列島，小笠原諸島以外からは記録がない種類（亜熱帯性の種）です。
＊Okajima, S. (2006) The Suborder Tubulifera, The Insects of Japan 2, Touka Shobo.
＊Masumoto, M. (2009) Taxonomic study of Japanese Thripinae (Thysanoptera, Thripidae), with consideration of supura-generic relationships based on morphological characters, Doctoral thesis, Tokyo University of Agriculture.
